以前大家認為凍干箱的真空度越高越好，現在認為凍干箱的真空度應根據不同的產品來決定，真空度太高或太低均對凍干不利，因此現代凍干機均帶有真空度調節裝置。

目前常用的調節方法有三種。

一種是從外界引入不凝性氣體到凍干箱內的方法，也叫漏氣法或摻氣法；在凍干箱的

放氣管路上安裝一個微調漏氣閥，再串聯一個由真空儀表控制的電磁閥；當需要進行真空調節時使電磁閥工作，并在真空儀表上設定真空度的控制范圍。當凍干箱的真空度達到設定值的下限（壓力低的數值或真空高的數值）時，真空儀表便接通電磁閥的電源，無菌空氣或氮氣通過微調漏氣閥和電磁閥進入凍干箱，漏入的氣體量應通過微調閥進行調節。若調節太大，會使漏入氣體太多，使凍干箱的壓力升得太多，甚至會發生真空報警；若調節太小，則漏入氣體太少，壓力不上升或上升太慢。合適的漏氣量應在電磁閥打開時調節，能見到壓力緩慢上升，在到達設定上限（壓力大的數值或真空低的數值）時，電磁閥關閉，氣體停止進入凍干箱。由于真空泵的抽吸作用，凍干箱的真空再次提高，電磁閥又打開，這樣便使凍干箱的真空控制在儀表設定的數值范圍之內。漏氣法也可使用流流量調節閥控制，這種方法僅需要一個閥門；對這個閥門進行控制可使真空控制在設定的數值上，而不是某一范圍；這種閥可開大，亦可全部關閉。

  另一種是控制抽空閥的方法。該法用真空儀表控制真空泵和冷阱之間的抽空閥的開閉，當凍干箱的真空度到達設定值的下*，抽空閥關閉，由于真空泵停上對冷阱和凍干箱的抽空，凍干箱的壓力逐步上升；當上升到設定值的上*，抽空閥打開，真空泵恢復對冷阱和凍干箱的抽空，凍干箱壓力又下降，抽空閥又關閉，使凍干箱真空度控制在真空儀表設定數值的范圍之內。對于真空漏率很小的凍干機，此法在凍干后期將出現控制不準的現象，即在關閉抽空閥后，凍干箱的壓力不僅不上升，而且會下降。

  第三種方法是用真空儀表控制安裝在主閥旁的調節閥方法。當凍干箱的真空度到達設定值的下*，真空儀表關小主閥，于是凍干箱的壓力上升，上升到設定值的上*，主閥又開大，使凍干箱的真空控制在儀表的設定數值的范圍之內。